Vamos começar com o que é - SL (ou Centos ou fedora) baixa um arquivo que lista todos os arquivos disponíveis no repositório e informações sobre esses arquivos. Também faz o download de um arquivo 'checksum', que é uma forma de identificar rápida e exclusivamente o outro arquivo de alguma forma.
Nesse caso, o arquivo de metadados foi corrompido durante o download, então tentou outro método. Em primeiro lugar, isso não significa necessariamente adulteração ou monitoramento, apenas significa que a conexão pode ter quebrado em algum momento, ou havia algo errado com o download.
Nunca atribua à malícia o que pode ser atribuído ao que provavelmente é uma falha aleatória. É bastante improvável que isso (sozinho) seja o sinal de que alguém está interceptando suas comunicações.