Desde que seja o mesmo sistema, ou o mesmo modelo de sistema, e o novo disco seja grande o suficiente, não haverá problemas.
Descobri que os sistemas mais modernos fazem possuem discos maiores de restauração de vários DVDs. Meu palpite é provavelmente um resultado de usar o WIM como base para o disco de restauração (que é bom, já que é um padrão) e, em vez de ativar um script para instalar o software, já está na imagem de instalação.