Pode haver software que possa fazer isso ...
No entanto, se precisar ser exato, você precisará verificar isso por conta própria. Quando você digitaliza um documento em papel para formatos digitais, pode e haverá erros. Mesmo os melhores programas de reconhecimento óptico de caracteres (OCR) cometem erros e ainda precisam ser verificados por um ser humano. Problemas como vincos no papel, um fio de cabelo no scanner, um papel que não fica liso, cores que não digitalizam bem, papel não alinhado corretamente, etc. podem causar falha na saída digital.
Se você precisa que suas contagens sejam precisas, você ainda precisará verificá-las. Recriar os planos em um formato digital é a única maneira de ser preciso.