No GIMP, use a janela Camadas para selecionar a camada que deseja isolar. Isso realçará a camada com uma caixa de linha tracejada.
Na janela principal da imagem, no menu Editar, selecione Copiar. Em seguida, no menu Arquivo, selecione Criar e, em seguida, Criar da área de transferência.
Isso cria uma nova imagem dentro dos limites da camada selecionada. Nenhum recorte é necessário (contanto que a camada seja o tamanho do elemento e não a imagem completa.) A única coisa sobre esse método é que ele mescla a imagem, mesclando todas as subcamadas juntas. Só precisa fazer as principais edições dentro da imagem original antes de copiar as camadas.