Para facilitar a interação entre o Bride e o Lightroom, é possível usar os rótulos de cor de bridge indo no menu do Lightroom para
Metadata -> Color Label Set
E, em seguida, escolha
Bridge Default
Ainda perdi o status de rejeitado, mas com os rótulos de cor de volta funcionando, é apenas uma questão de excluir permanentemente as imagens rejeitadas antes de importá-las para o Lightroom, e estou pronto para usá-las. Outra solução para aqueles que não quero excluir ainda é não usar o status rejeitado, mas um dos rótulos de cores.
Então a solução estava em configurações e em um ligeiro ajuste do meu fluxo de trabalho.