lornix está certo.
Na janela de propriedades, você verá a opção "Executar" com uma lista suspensa. Por padrão, ela é definida como "Janela normal" . Altere para "Maximizado" . Isso deve resolver o problema.
Se isso não funcionar, você pode estar tentando executar um aplicativo da Web com dimensões de janelas predefinidas (como mencionado por tumchaaditya ).