Você cria um script em lote que exclui o conteúdo da pasta de download. E, em seguida, crie a versão do windows do cron e execute-a em intervalos designados.
Lote para excluir o conteúdo da minha pasta.
FOR /D %%i IN ("D:\myfolder\*") DO RD /S /Q "%%i" DEL /Q "D:\myfolder\*.*"
Excluir pastas com mais de N
forfiles -p "C:\what\ever" -s -m *.* -d <number of days> -c "cmd /c del @path"
Documentação do Forfiles: link
e cron para windows: link