Esses cabeçalhos de 9 pinos são na verdade 10 pinos. O 10º pino geralmente está faltando ou é cortado de forma que ele seja "digitado" corretamente e uma conexão USB típica não esteja conectada ao contrário ou algo do tipo.
A outra coisa a entender (e isso pode ser crítico) é que você está realmente conectando 2 portas USB no conector de 9 pinos. Portanto, você precisa ter certeza de que não está misturando e combinando os sinais de dados entre as duas portas USB diferentes. Nenhum dano real irá ocorrer, mas nada irá funcionar corretamente também. As outras partes da conexão USB também são muito importantes e fornecerão a conexão de + 5VDC e de aterramento - certifique-se de acertar as ligações ou você quase certamente terá problemas.
Na maioria das mobos onde este cabeçalho de 9 pinos é usado (como todos eles), uma porta USB usa os pinos ímpares enquanto a outra usa os pinos pares. Nem sempre, mas geralmente. Seja cuidadoso! Às vezes, esse cabeçalho não é usado nem para USB. Às vezes é um cabeçalho de porta serial RS-232 ou pode até ser uma porta firewire 1394.
Portanto, supondo que você tenha todas as conexões certas, eu diria que você talvez precise de drivers USB. O Windows geralmente detecta o USB, mas quase sempre erra quando você não atualiza os drivers do fabricante do seu mobo (pelo menos é o que eu pareço ter sempre que passar). Obter os drivers corretos instalados e você deve estar pronto para ir. No entanto, você pode primeiro ter que aplicar o suporte correto ao chipset instalando drivers ou um patch para isso antes mesmo de pensar em instalar o suporte USB. (Eu não posso dizer desde que eu não sei o que você tem). No entanto, uma vez que o suporte adequado ao chipset esteja funcionando, o Windows pode detectar o material USB correto e você pode não ter mais nada a fazer.
Espero que ajude ...