ar: -L/home/limksadmin/hpl-2.0_FERMI_v13/lib/CUDA/libhpl.a: No such file or directory
Esta linha está dizendo que não é possível encontrar o arquivo de biblioteca estática HPL apropriado para CUDA. Uma coisa que você pode tentar fazer (se você sabe que está 100% positivo, tudo está configurado corretamente no Makefile) é adicionar o caminho exato, sem o nome do arquivo, à sua variável de ambiente LD_LIBRARY_PATH
:
export LD_LIBRARY_PATH=/home/limksadmin/hpl-2.0_FERMI_v13/lib/CUDA/:$LD_LIBRARY_PATH