Parece algumas coisas:
1) Coincidência. A unidade pode estar morrendo e você reinstalar o Windows 7 não é a causa. Você pode determinar isso inicializando em um ambiente LiveCD como o Ubuntu ou o OpenSUSE e executando o Utilitário de Disco na unidade. Você pode usar testes curtos ou longos para determinar qualquer falha e verificar o relatório de erros SMART para ver quantos setores foram remapeados e outras estatísticas que podem ser alarmantes. Remapear setores é perfeitamente normal, mas se for um monte deles (perto do "max") então a unidade provavelmente começará a falhar.
2) A unidade utiliza software feito pela Transcend (os fabricantes da série Storejet) para interagir adequadamente com a unidade. Melhor procurar o modelo que você tem no site da Transcend e ver se eles têm utilitários em torno disso.
3) Os drivers USB podem estar desatualizados ou os drivers do chipset também. Melhor atualizá-los.
4) O Windows pode estar colocando a unidade em um modo de economia de energia. Você precisará passar pelo gerenciador de dispositivos e acessar as propriedades do dispositivo e desabilitar as configurações de economia de energia que ele definiu lá. Isso pode não ser necessário.