Vale a pena executar uma verificação no disco para verificar se eles estão sem erros, há muitas ferramentas no CD de inicialização do Hiren para isso.
Você está usando o RAID de hardware (configuração no BIOS). Aqui é um ótimo post sobre 'reparar' uma configuração RAID 0 danificada de um thread com muitas outras informações úteis.
Dependendo do seu controlador RAID, pode haver algum software de reparo que você possa executar. Verifique o site dos fabricantes para mais informações. Highpoint , Adaptec etc