As ramificações criadas localmente no Git são simplesmente arquivos dentro do diretório .git/refs
que contém hashes SHA1 dos objetos de confirmação do Git. Portanto, você pode remover essas ramificações excluindo os arquivos apropriados.
Essa ramificação em particular provavelmente está no diretório .git/refs/heads
; se assim for, este comando deve funcionar a partir da raiz do repositório:
del ".git\refs\heads\OneNote Table Of Contents.onetoc2"