Se o seu primeiro disco rígido falhou, você pode descobrir que existem setores defeituosos no disco que causariam a falha de um programa padrão de clonagem de disco.
Eu recomendaria que baixasse um BootCD do Linux (como o último Live CD do Ubuntu) e use o Gddrescue para criar uma imagem da unidade defeituosa em outra unidade. O Gddrescue varrerá a unidade em busca de todos os setores bons, depois voltará às áreas ilegíveis e tentará recuperar os dados dessas áreas (o que leva muito tempo). Depois de ter uma imagem completa, você pode usar o dd para copiar para a nova unidade.
Se você tiver apenas a nova unidade, há uma opção para recuperar os dados da unidade diretamente em outra unidade. Você pode ler mais sobre como usar o gddrescue aqui .