O VirtualDub seria minha recomendação. Apenas siga as instruções aqui.
edit:
Arquivos DAT e arquivos vob são formatos MPEG em diferentes arquivos contêineres. Se você deseja imprimir em mpeg, tente o AVIdemux. Está mais atualizado.
Existe uma ferramenta de código aberto para mesclar vídeos junto com a codificação. Mesclar em um sentido para mesclar vcd cd1 e vcd cd2. ou mesclar diferentes capítulos de dvd. pode handbrake fazer isso?