Este link do MSDN especifica exatamente o que está incluído, e excluídos do índice:
Folders and Files Excluded
The following folders are excluded by default:
The following %SystemDrive% directories and their contents are not indexed:
- \Build\
- \Installed Repository\
- \ProgramData\ (except the shared Start Menu directory)
- \Program Files\
- \Program files (x86)\
- \Users\Default
- \Windows\
- \Windows.000\
- \Windows.old\
- \$Recycle Bin\
Default User folders.
- Any item marked as Hidden or System.
- Removable drives.
- Files without extensions or filters. Windows Search does not assume that a file format necessarily contains text.
Para informações sobre algumas alternativas, talvez confira esta pergunta do SU:
Melhor maneira de confiantemente pesquisar arquivos e conteúdos no Windows sem usar um serviço de indexação?