O novo serviço iTunes in the Cloud da Apple deve mostrar o download de itens comprados novamente.
Acredito que a pasta que você deseja copiar para preservar seus dados é Music\iTunes\*
em seu diretório pessoal.
Se você tiver itens que não comprou pela Apple e não foram sincronizados com o iPhone, provavelmente eles não terão usado o software de recuperação de dados em seu disco rígido.