Depende, normalmente a BIOS será configurada para usar o PCI-E como um override, então você poderá conectar a placa gráfica e conectar um monitor e ele funcionará. Você não terá a melhor resolução até que os drivers corretos tenham sido instalados para a placa, então instale uma vez que o Windows inicialize.
Se você configurou sua bios para executar somente a partir dos gráficos onboard e não pode obter a bios em seu monitor, consulte o manual da sua placa-mãe para resetar suas bios, pois os padrões devem permitir a detecção da PCI-E. cartão.