Desculpe, mas a resposta não é tanto quanto eu sei ...
A única exceção, é claro, é quando as duas camadas não "se sobrepõem" umas às outras (ou seja, elas não têm partes não transparentes uma acima da outra) - nesse caso, altere ambas as camadas para o modo normal, mescle-as e, em seguida, altere o resultado mesclado para estar no modo de sobreposição.