O problema é apenas com um determinado projeto seu ou com todos os projetos?
Em algum momento, eu inseri um arquivo mp3 em uma classe (áudio de voz de 16kbps), que Eu criei da mesma forma como milhares de vezes antes. Mas desta vez, isso leva a o compilador flash para desligar (mantendo comendo toda a velocidade do processador daquele processador do meu quad core). (Eu não esperei por 15 minutos, pois a compilação duraria apenas alguns segundos). O problema era reproduzível quando eu embuti o arquivo de áudio em qualquer classe, em qualquer projeto, quando construído usando o Flash Pro CS5.5 e ao compilar usando o FlashDevelop 4.0.0rc2.
Conclusão: é possível fazer com que o compilador flash seja bloqueado por algum conteúdo especial de um arquivo mp3 incorporado.