Na verdade, isso foi fácil. vgreduce --removemissing fez o trabalho para mim. Acho que foi muito precipitado em postar a questão.
Eu tenho um volume lógico / home que mostra os volumes físicos ausentes. "Não foi possível encontrar o dispositivo com uuid 'jhueouoe-eoueok-ceokek-chkoke'". Eu removi esse volume físico algum tempo atrás (após a migração dos dados). Agora minha pergunta é como posso limpar os metadados do volume lógico? Eu não sou capaz de adicionar novos volumes físicos por causa disso.