Você não pode.
Uma unidade de rede é vista como apenas um disco rígido para o resto da rede. A única proteção é garantir que todos os computadores na rede tenham o software antivírus instalado. Não é realmente viável em um ambiente onde qualquer pessoa pode vir e anexar ao seu WiFi.
Não há software que possa ser executado em uma unidade de rede, pois não há sistema operacional padrão para essas unidades (algumas executam o Linux, algumas executam o Embedded Windows, outros softwares personalizados etc.) e não têm a capacidade de processamento para poder enfrentá-lo de qualquer maneira.
Seria melhor ter uma área compartilhada em um computador que esteja executando um software antivírus. Isso pode proteger a si mesmo e realizar verificações regulares da área compartilhada para melhor proteção. Sim, custa mais do que um simples NAS, mas é mais seguro.