Meu instinto me diz um possível problema de disco rígido na máquina host. Com o custo atual das unidades, não deve ser muito caro obter outra unidade e cloná-la. Na maioria dos casos em que experimentei ou tive clientes que tiveram um comportamento esporádico semelhante em uma situação semelhante, pouco tempo depois eles tiveram falhas no disco rígido e não tiveram backups.