Encontrei esta pergunta há muito tempo depois que fiz a pergunta ... há um tempo atrás, encontrei a resposta, então aqui está:
Em uma janela flutuante do jEdit, no canto superior esquerdo haverá um triângulo invertido que, quando clicado, exibirá normalmente um menu com itens como "Encaixe em cima", "Encaixe em baixo", "Encaixe à esquerda", "Dock à direita"; se esses menus não aparecerem, é porque a área de encaixe foi desativada. Para ativar a área de encaixe, clique em:
View->Docking->Toggle Docking Area
Em seguida, retorne ao menu de triângulo invertido da janela flutuante, onde a opção "Doca na < direção >" menus aparecerão e permitirão que você encaixe janelas flutuantes.