Eu provavelmente usaria o GraphicsMagick para isso:
gm convert -delay 200 -loop 50 frame*.gif animation.gif
O que lhe daria um atraso de 2 segundos entre cada quadro e uma imagem em loop.
Se você quiser, também pode usar o ImageMagick com a mesma sintaxe.
Se você estiver no Windows, há outras opções que são menos eficientes, mas mais fáceis de usar: