A maneira de fazer isso é colocar o arquivo em um diretório e revogar as permissões "r" e "x" no diretório de quem você não quiser. Não há uma maneira padrão de ocultar um arquivo apenas modificando as permissões do próprio arquivo.
Se poderíamos ocultar a presença de um arquivo modificando o gid / uid?
A maneira de fazer isso é colocar o arquivo em um diretório e revogar as permissões "r" e "x" no diretório de quem você não quiser. Não há uma maneira padrão de ocultar um arquivo apenas modificando as permissões do próprio arquivo.