Você obteria melhor desempenho do SSD do que da unidade mecânica, desde que o SSD seja grande o suficiente para as suas necessidades.
Eu tenho uma nova máquina com um SSD como a unidade principal, executando o Windows 7 de 64 bits e uma unidade de 7200 RPM de 500 GB como a unidade secundária.
Eu tenho uma VM configurada no VMWare que tem um ambiente de desenvolvimento dentro dela (Windows XP com VS2010 e MySQL).
Seria melhor para o desempenho da VM executar essa VM no SSD ou no segundo disco rígido?
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