dados seus requisitos, eu aconselharia escrever um script perl ou python. Ambos os idiomas terão suporte de biblioteca adequado para permitir que você realize quaisquer operações que desejar nos dados do arquivo.
Estou procurando um programa freeware que compara dois arquivos binários entre si e pode fazer o seguinte:
Se você conhece um programa como este, por favor poste.
dados seus requisitos, eu aconselharia escrever um script perl ou python. Ambos os idiomas terão suporte de biblioteca adequado para permitir que você realize quaisquer operações que desejar nos dados do arquivo.
Eu ficaria surpreso se houver um programa existente que faça tudo o que você quiser - sem algum nível de esforço de programação.
Os Gnu diffutils podem fazer um pouco disso e há uma comparação de algumas ferramentas em Wikipedia