Eu não tenho mais o Word 2000, mas não me lembro de um problema desse tipo quando o usei.
Por favor, use o botão ¶ do Word (se parece com a letra maiúscula em grego Pi) para exibir os caracteres que você tem no final dos parágrafos. Todos eles devem se parecer com ¶ (Pi) se forem fim de parágrafo.
Se o problema for causado por uma macro ou um plug-in, você poderá verificar essa hipótese desabilitando-a:
Vá até o menu Ferramentas e selecione "Macro". No novo submenu, selecione "Segurança". Vá para o "Nível de segurança" e selecione "Alto": somente macros assinadas de fontes confiáveis podem ser executadas. Agora, na guia "fontes confiáveis", remova todos os itens (se houver) e desmarque a caixa "Confiar em todos os suplementos e modelos instalados".