Você está usando o jackd? Nesse caso, tente aumentar os quadros por período. Além disso, se você não estiver usando o kernel de baixa latência, tente. Certifique-se de que a taxa de amostragem esteja definida adequadamente.
Eu baixei o lmms para o meu sistema Ubuntu 04.04 e comecei a tentar usá-lo, mas uma vez que comecei, todos os sons no LMMS estavam todos distorcidos e não pareciam certos. Alguns até não tinham som. Existe alguma maneira de corrigir isso?