No Eclipse, você tem uma visão que mostra o que está acontecendo em segundo plano. O Netbeans tem um pouco de "atividade" na barra de status, mas não é usado por todos ou há outras coisas acontecendo.
A primeira coisa a tentar é dar ao NetBeans 1GB de RAM . Se isso ajudar, você foi atingido pelo coletor de lixo.
Se isso não ajudar, você pode enviar um sinal para o processo Java para que ele seja despejado threads.