Genie Timeline Professional pode fazer isso para você de uma forma ainda melhor do que o Time Capsule ,
ele não consegue ver o Time Capsule, então você precisará de um disco rígido externo ou de uma unidade de rede para fazer o backup.
EDITAR:
Você pode tentar Usando o Cobian Backup no Windows com o Time Capsule da Apple .
Se isso não funcionar, aqui estão meus pensamentos:
You are mixing up MS stuff with *nix stuff and are looking for problems by just doing that. The best hope you can go for is to check if the Time Capsule can be configured to enable Windows Sharing (Samba), and even if you do have that backing up won't work perfectly and will be slow or you might even not have write permissions to it. Also note that the size management of the Time Capsule will work less well than expected. One car can drive on Diesel, the other one will need LPG...