A partir do VPS atual, você pode criar um tarball do seu diretório inicial:
cd ~ && tar czf myhome.tgz ./
Depois, no novo VPS, você pode descompactar este tarball:
cd ~ && tar xzf myhome.tgz
Você pode considerar descompactar um diretório tmp primeiro e depois copiar apenas o que precisa:
mkdir tmp; tar xzf myhome.tgz -C tmp