Você poderia investir em um cooler de ventilador de laptop. Você sabe aqueles que você coloca sob o laptop para se certificar de que os ventiladores de entrada estão recebendo fluxo de ar extra. Alguns laptops mais tarde em sua vida ficam entupidos. Pode valer a pena desmontá-lo e simplesmente apagá-lo. Geralmente isso é fácil de fazer.
Mais visando o lado do Ubuntu. Você pode diminuir a freqüência do processador no Ubuntu.
sudo apt-get install indicator-cpufreq
Você também precisa separá-lo do processo de inicialização adicionando um script de inicialização. Basta digitar "Startup Applications" no travessão e adicionar seu script bash ao iniciar o aplicativo.
Se for GPU, você pode querer pensar em mudar para drivers abertos ou drivers fechados e ver se isso ajuda. Você também pode tentar algo que exija menos recursos do sistema e transformar efeitos do sistema em algo como o Compiz Config Settings Manager. É um pouco avançado, portanto, seja um pouco cuidadoso com o que você desliga.
sudo apt-get install compizconfig-settings-manager