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Se você estiver visualizando legendas no QuickTime, você já está usando outro software (como o Perian, etc). Minha sugestão seria usar o VLC, que oferece algumas alterações nas legendas através de Ctrl + H, Ctrl + J durante a visualização.
A que distância estão as legendas? A segunda resposta a esta postagem fala sobre a edição do arquivo SRT para alterar manualmente os horários de início e término. Meu entendimento é mais uma vez que o VLC faz melhor com isso do que o QuickTime.
JDB