o seu gerenciador de janelas determina o 'título' da janela, observando a propriedade WM_NAME da janela (outros acessórios também podem ser usados, mas o WM_NAME é comum). você pode obter essa propriedade por:
%> xprop WM_NAME <enter_and_click_onto_the_window>
usando
%> xprop -set WM_NAME "this is the new title" <enter_and_click_onto_the_window>
você pode definir um novo título. que poderia fazer o que você quiser. veja 'man xprop' para mais informações.