É claro que chkdsk sob o windows é necessário. Mas eu sugiro adicionalmente limpar índices neste disco. simplesmente abra as propriedades para o disco C: \ pressione "Limpar disco" ou "disco de varredura", isso é sob círculo mostrando o uso do disco (eu tenho outra linguagem do Windows e não pode traduzir isso perfeitamente), aguarde algum tempo para verificação do Windows. depois pressione o botão "limpar arquivos do sistema" e aguarde anogher para verificar. finalmente selecione o que você deseja remover.
Existe outro separador "Mais opções". Em seguida, limpe "Restauração do sistema e cópias em segundo plano".
vejo alguns artigos sobre isso: link
isso explica, esse índice corrompido é reparado, mas originalmente o bug no fs não muda.
se menos arquivos de sistema, então é melhor:)
outro artigo técnico da ms: link
Neste ponto alguma corrupção na MFT, mas o chkdsk ignora esses bugs.
Você pode 'consertar' isso pelo volume de desfragmentação com MFT. programa MyDefrag fazê-lo com segurança, eu estou usando isso por muito tempo.
Outro problema é que sua memória pode estar corrompida. O NTFS é muito sensível para isso. Execute qualquer teste, talvez o memtest86 esteja ok, coloque isso em funcionamento por 1 dia.
Não tenho outra ideia.
UPDATE
Eu encontrei outro artigo utilizável (eu acho):
link
mas recomendo primeiro verificar sua RAM