Eu naveguei pelos fóruns no natara.com (eles estavam inativos ontem) e tropecei no seguinte link útil, que pode responder à minha pergunta:
link
Tentaremos amanhã e atualizaremos esta questão. A parte complicada estava em especificar o grupo de trabalho e o usuário durante a abertura no MS Access. Estou copiando a parte principal abaixo:
msaccess.exe "C:\DayNotezTMP\UserName DayNotez.dnz" /wrkgrp "C:\DayNotezTMP\UserName DayNotez.mdw" /user DayNotez
Atualização: Tentei e funcionou para mim. Agora tenho todos os dados do DayNotez em arquivos Excel e XML. Irá descobrir as APIs do Evernote para importar todas essas coisas.