Você não pode controlar a saída do PowerPoint para excluir o ActiveX, etc.
A melhor maneira para você é exportar sua apresentação para imagens e, em seguida, incorporá-las em páginas HTML (eu recomendo o plugin Lightbox JS, então você pode ir para frente e para trás bem).
Sevocêestiverdispostoapagar,hátambémsoftwaresdeterceirosparaconvertersuasapresentaçõesparaaweb.Quãobemelestrabalham,emboraeunãotenhaideia.
AterceiraetalvezmelhormaneiradecolocarsuaapresentaçãonawebéusarafunçãoApresentaçõesdoGoogleDoc.EnviesuaapresentaçãoedeixequeoGDocsatorneumaapresentaçãodaWebmuitoeficiente.