Descobri isso. O problema é que, por padrão, o Quicksilver ocupa apenas alguns níveis em uma hierarquia de pastas, e aparentemente trata algo mais profundo como um URL.
Consulte o tópico "O Quicksilver não encontra meus arquivos" na FAQ do Quicksilver para obter instruções sobre como criar um conjunto de catálogos personalizado que será analisado mais profundamente.