Nos casos em que você instalou os pacotes .deb fora de quaisquer repositórios localizados em /etc/apt/sources.list**
você é de fato o responsável por atualizá-los.
Fique de olho nos novos lançamentos (eu faço isso inscrevendo-se no feed RSS do blog do projeto, por exemplo) e quando uma nova versão for lançada, basta repetir as etapas que você realizou na instalação inicial do pacote .deb:
- faça o download do .deb no site do projeto
- instale-o por qualquer
- clicando no seu navegador para instalá-lo usando o centro de software
- ou executando
sudo dpkg -i ~/Downloads/<filename>.deb
Em alguns casos, há um PPA na barra de lançamento que fornece pacotes fornecidos pela comunidade e atualizações mais ou menos regulares. Embora você realmente deva verificar se o autor desses pacotes tem credibilidade suficiente para instalar seus pacotes em seu sistema.