Eu fiz o upgrade de 3.4.1 para 4.0.2 e funcionou. No entanto, obtive melhores resultados com
>ffmpeg -hide_banner -v warning -i logo.gif -filter_complex "[0:v] scale=320:-1:flags=lanczos,split [a][b]; [a] palettegen=reserve_transparent=on:transparency_color=ffffff [p]; [b][p] paletteuse" logo-320.gif
Para evitar um artefato de linha branca ao redor da borda, adicionando palettegen=reserve_transparent=on:transparency_color=ffffff
.