Rodando 10.04 e 10.10 (talvez antes disso) eu notei que para alguns diálogos aceitarem entrada o cursor do mouse deve estar na janela pai. Esse é o caso, embora a janela que destaca a caixa de diálogo esteja em foco.
Existe controle de configuração exposto para esse comportamento? Estou particularmente interessado em controles GUI. Eu olhei para as preferências de mouse e janela - sem alegria.
Você ativou um recurso chamado "foco segue o mouse" em algum momento? O comportamento que você descreve como esta opção está ativado no seu sistema. Verifique as preferências da janela, ou então gconf (usando gconf-editor ) para uma configuração com esse efeito. Caso contrário, talvez pesquisando o termo irá ajudá-lo.
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