Os aplicativos que podem realmente lidar com as configurações de DPI devem permitir que você especifique o DPI quando ele é convertido.
DPI nada mais é do que uma conversão de pixels para tamanho físico.
Você não especifica o editor de imagens que está usando, mas sei que o Photoshop tem essa configuração.
Você costuma definir isso na tela de redimensionamento do documento. Você pode optar por alterar a configuração de DPI, mas manter a resolução em pixels igual. Você pode ter que calcular o que a largura e a altura se tornarão no CM usando a nova configuração de DPI para que ela seja dimensionada corretamente, mas manterá todos os pixels iguais.
O que eu costumo fazer é o seguinte: na tela de redimensionamento da imagem, primeiro copio a largura da quantidade de pixels que já possuo e mudo a configuração de DPI. A largura muda. Eu colo de volta o valor antigo e agora as medidas do CM mudam. Eu bati OK. As dimensões da imagem mudam, mas a quantidade de pixels permanece a mesma. E o DPI também mudou.
Dito isso, observe que, se você não alterar a configuração de DPI de qualquer maneira e não redimensionar a imagem, a mesma escala ocorrerá automaticamente quando você imprimir a imagem.
Observe também que, se você manter a mesma quantidade de pixels e aumentar o DPI, o tamanho físico se tornará menor. A imagem será mais nítida quando impressa, mas também menor. Se você diminuir o DPI, as dimensões físicas aumentam, mas a imagem fica pixelada.
Se você deseja uma imagem maior com mais DPI, precisa de mais pixels.