O artigo da Microsoft O Office instalado com o Click-to-Run e o Windows Installer no mesmo computador não é suportado diz isso:
Click-to-Run is the technology used to install Office 365 subscription and most other Office 2013 and Office 2016 products. Windows Installer technology (MSI) is used to install the volume license editions of Office, like Microsoft Office Professional Plus and Microsoft Office Standard.
Unfortunately, you can't have Office products of the same version (like 2013 or 2016) that use two different installation technologies installed on the same computer. This also applies to standalone applications like Access, Visio, Project, Skype for Business, or OneDrive for Business.
Então, infelizmente, isso é impossível, a menos que você instale uma das versões em um ambiente virtual, como uma máquina virtual ou usando Sandboxie . Seu problema será usar documentos no ambiente virtual de fora dele.
Veja também:
Cenários suportados para instalar diferentes versões do Office, Visio e Project no mesmo computador