O Google Chrome tem uma configuração que pode ser alternada (às vezes acidentalmente) e excluirá todos os cookies sempre que o navegador for fechado.
A partir de junho de 2018, no Chrome 67, esta configuração está localizada em chrome://settings/content/cookies (Configurações > Privacidade e segurança > Configurações de conteúdo > Cookies) e é chamada " Manter dados locais somente até você sair seu navegador ".
Essa configuração deve ser desativada se você quiser preservar logins e cookies entre as sessões do navegador.