Você tentou instalar libgpod-dev
?
sudo apt-get install libgpod-dev
De acordo com o arquivo INSTALL
do tarball, você precisa instalar as seguintes dependências para criar gtkpod2.1.4
:
Os seguintes pacotes são necessários para a criação do gtkpod:
autoconf (at least 2.55) flex (or lex) gettext glib gtk+ (gtk2 for the 2.0.x stream / gtk3 for the 2.1.0+ stream) libgpod (at least 0.6.1) libgdl anjuta libid3tag (at least 0.15) libgnome-vfs-2.0 > 2.6 (for iPod autodetection under GNOME)