Eu sugeriria usar o Cairo porque ele tinha mais configurações disponíveis. Eu executo o Lubuntu 12.10 com o gerenciador xcompmgrm ativado e não tenho problemas com o fluxo de trabalho. Eu posso rodar multi painéis e escolher quais lanchonetes eu quero.
Fácil de instalar, basta abrir o synaptic e escolher o cairo-dock. Ele irá fornecer as dependências corretas e você está fora e funcionando.