ATUALIZAÇÃO (Fixo)
Como não há respostas para eu aceitar, acho que adicionarei minha solução aqui.
Depois de executar CHKDSK /R /F /X
repetidamente (sentida como um milhão de vezes, de 4 a 6 horas de cada vez), não foram encontrados mais setores defeituosos.
Eu formatei a unidade com as opções de inicialização:
...então(emoutramáquina)fezodownloadda
Eu alterei a ordem de inicialização para inicializar a partir do USB, onde instalou o Windows, e não tivemos nenhum problema desde então.