Aparentemente, a --init-command=COMMANDS
opção de inicialização foi adicionada ao peixe 2.7
Algo ao longo da linha de deve fazer o truque:
fish --init-command='source /path/to/alternate/fish.config'
Mas não posso testar, já que estamos usando o peixe 2.4.0. Talvez haja uma solução alternativa?