Tente executar em um terminal:
htop ou free -m
htop precisa ser instalado com sudo apt-get install htop , mas fornecerá mais informações, como o uso da CPU. free relatará apenas o uso da memória.
Veja os resultados para ver se você não está usando swap (pouca memória RAM) ou se a sua cpu não está sendo comida por algum outro processo.
OBS: você também pode usar top pré-instalado, mas acho que sua saída é confusa ...